Ученые разработали программу для сборки вирусных геномов.

Новая разработка, по словам специалистов, упрощает подготовку к созданию вакцин против новых вирусов
Ученые создали новую программу, которая собирает геномы вирусов для того, чтобы их впоследствии расшифровать. Разработка работает быстрее аналогов, пишет пресс-служба СПбГУ со ссылкой на статью в научном журнале Bioinformatics.
Для того, чтобы создать вакцину или тест для обнаружения любого неизвестного ранее вируса, нужно расшифровать его геном. Однако, например, в ситуации с коронавирусом нового типа в качестве образца ученые использовали слюну пациентов, в которой были геномы многих других, в большинстве случаев безвредных вирусов и бактерий изо рта человека. В результате можно получить тысячи генетических последовательностей, а какие именно данные относятся к нужному патогену, понять непросто.
Чтобы упростить эту задачу, ученые из России и США создали специальную программу-сборщик вирусных метагеномов metaviralSPAdes. С ее помощью геномы вирусов можно расшифровывать быстрее и удобнее, пишет пресс-служба.
В пресс-службе добавили, что программа позволит проще выполнять масштабные вычислительные задачи, – в частности, проводить переписи вирусных геномов различных животных, например, летучих мышей, которые являются потенциальными источниками будущих эпидемий.